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使用ggplot2绘图

课后问答

问： 老师，请问有没有专门用ggplot2绘制各种类型好看图的网站或者公众号推荐？另外就是如何获取文献中看到的用ggplot2画的漂亮图的代码？谢谢

答： 目前没有发现专门介绍ggplot2的公众号。

第一课推荐的公众号上有很多资源可以参考：

• ecoinformatics
• 生态学文献分享
• 小明的数据分析笔记本
• R语言与藻类生态学
• Y叔（YuLabSMU）
• 生信小白鱼
• listenlii
• 科白君的土壤世界
• 庄闪闪的R语言手册
• 北野茶缸子
• R语言学堂
• 统计之都

也可参考此链接： https://github.com/helixcn/awsome-R-ecology-evolution

现列出几个ggplot2有关的网站供参考：

• https://bookdown.org/content/b298e479-b1ab-49fa-b83d-a57c2b034d49/
• https://www.r-graph-gallery.com/
• http://r-statistics.co/Top50-Ggplot2-Visualizations-MasterList-R-Code.html
• https://exts.ggplot2.tidyverse.org/gallery/

当然，最重要的网站还是 https://r-graphics.org/，因为这本书的作者Winston Chang就是ggplot2的作者之一。

问： geom_base()是不是取消了呢？我这边没有，还是我版本问题？说错了，是theme_base()

答： theme_base()是ggthemes包的一个主题。要想用这个主题，先要安装ggthemes包，并用library(ggthemes)导入。

问： facet能控制部分小图拟合，部分不拟合曲线吗？

答： 可以，但是目前实现起来可能比较复杂，需要用if去判断。 建议还是先拟合全部的小图，导出为pdf，然后再用Illustrator删去不需要的趋势线。也可以用eoffice包，导出为ppt格式，编辑到自己需要的效果后再导出。

问： geom_smooth可以自定义拟合线吗？就是根据自己的参数，画不同的曲线

答： geom_smooth()可以设置为: "lm"、"glm"、"gam"、"loess"、MASS::rlm、mgcv::gam等，如果真要自己写， 就需要用layer写新的图层，控制ggproto等，情形就比较复杂了。Hmisc包提供了lowess平滑方法，可供参考。

Bilibili网友留言：

看到图片另存为其他格式时，介绍了export这个包，但该已不在库里了，不能使用了，如何办？而图中有中文时，另存为svg、eps等图时，为乱码，如何解决？我的解决办法是：在Rstudio中，在生成的图片处上方工具栏处，点击export按钮，选择copy to clipboard，然后选左下角的Metafile，再选copy plot，回到ppt或Illustrator中，直接粘贴，就可以对带有中文的图进行编辑了。 但要注意，如果直接export另存为svg, eps等格式，则用AI打开时，图中的中文为乱码。不知道有无其它的方法。"

网友留言：

export包现在好像没有维护了，如果不能用，可以用eoffice包